無菌實驗室主要用於生物化學、生物醫學、微生物學、動物實驗、基因重組以及生物製品等研究使用的實驗室，統稱潔淨實驗室。
一、無菌實驗室規劃方案及平面佈局
1.組成：無菌實驗室由準備室、洗滌室、滅菌室、無菌室、恆溫培養室和普通實驗室六部分組成。這些房間的共同特點是要求地板和牆壁的質地光滑堅硬，儀器和設備的陳設簡潔，便於打掃衛生。
2.內外間要求：無菌實驗室應有內、外兩間，內間是無菌室，外間是緩衝室。所有的房間面積不宜過大，吊頂不宜過高，要便於空氣滅菌。
3.安全要求：無菌試驗室、生物安全實驗室須保證人身安全、環境安全、廢棄物安全和樣本安全，能長期而安全地運行，同時還需要為實驗室工作人員提供一個舒適而良好的工作環境。
二、無菌實驗室基本要求和配置條件
1.準備室——準備室用於配製培養基和樣品處理等
室內設有試劑櫃、存放器具或材料的專櫃、電源、電爐、冰箱、實驗台和上下水道等。
2.洗滌室——洗滌室用於洗刷器皿等
由於使用過的器皿已被微生物污染，有時還會存在病原微生物。因此，在條件允許的情況下，設置洗滌室。室內應備有加熱器、蒸鍋，洗刷器皿用的盆、桶等，還應有各種瓶刷、肥皂、洗衣粉、去污粉等。
3.滅菌室——滅菌室主要用於培養基的滅菌和各種器具的滅菌
室內應備有烘箱、高壓蒸汽滅菌器等滅菌設備及設施。
4.無菌室——是系統接種、純化菌種等無菌操作的專用實驗室
無菌室也稱接種室，在微生物工作中，菌種的接種移植是一項主要操作，這項操作的特點就是要保證菌種純種，防止雜菌的污染。在一般環境的空氣中，由於存在許多塵埃和雜菌，很易造成污染，對接種工作干擾很大。
三、無菌實驗室建置和裝修的主要組成部分
1.密閉良好的圍房構建。
2.易淨潔衛生的地坪處理。
3.空氣調節與循環淨化過濾系統。
4.靈敏的潔淨檢測系統與控制系統。
5.設計合理的氣壓力隔離系統。
四、無菌實驗室的設計方案
01無菌實驗室整體結構
◆無菌實驗室設計的各項建築物應堅固耐用、易於維修、易於清潔，並具備能防止食品、食品接觸面及內包裝材料遭受污染(如有害動物的侵入、棲息、繁殖等)的結構。
◆為防止交叉污染，應分別設置人員通道及物料運輸通道，人員通道應按潔淨室通道要求嚴格執行，各通道應裝有空氣幕(即風幕)或雙向彈簧門及電子滅蠅(蚊)器等防蟲設施。
◆須將通向外界的管路、門窗和通風道四周的空隙完全填充，所有窗戶、通風口和風機開口均應裝上防護網。
◆無菌實驗室的高度應能滿足工藝、衛生要求，以及設備安裝、維護、保養的需要。
02無菌實驗室的操作台
◆無菌工作區用無菌操作台，或者用潔淨工作檯代替，需要放置在離門最遠的地方。
03無菌實驗室的地面
◆無菌實驗室設計的地面應使用無毒、防滑、不滲水、不吸水、無裂隙且易於清洗消毒的建築材料鋪砌（如耐酸磚、水磨石、混凝土等），地面應有適當坡度（以1.0~1.5%為宜）。
04無菌實驗室屋頂與天花板
◆屋頂和天花板應選用不吸水、表面光潔、無毒、防霉、耐腐蝕、易清潔的淺色材料覆塗。
◆食品及食品接觸面暴露的上方不應設有蒸氣、水、電氣等輔助管道，以防止灰塵或冷凝水等落入。
05無菌實驗室牆壁與門窗
◆無菌實驗室的牆壁應採用無毒、不吸水、不滲水、防霉、平滑、易清洗的淺色材料構築，用此材料裝修高度應直至屋頂。
◆所有門窗結構應採用防鏽、防潮、易清洗的密封框架。
06無菌實驗室採光、照明設施
◆無菌實驗室應有充足的自然採光或人工照明，加工場所工作面的混合照度不應低於300LUX，配料及灌裝車間不應低於800LUX。
07無菌實驗室空氣處理淨化設施
◆無菌實驗室須安裝有效的通風設備，其空氣流向應從清潔區域流向非清潔區域，採用機械通風時，換氣量應大於3次/小時。
◆無菌實驗室溫度應控制在15~27℃之間，濕度控制在50%以下為宜。
◆無菌實驗室入口處應分別設有人員和物料的淨化設施。
五、無菌實驗室的管理與消毒
無菌實驗室內部裝飾、消毒要求都很嚴格：
◆無菌實驗室應每次使用前後用0.1%苯扎溴銨溶液或2%甲醛液擦拭工作檯面及可能污染的死角，濕拖地面，打開無菌空氣過濾器及超淨工作檯的開關30分鐘，紫外線殺菌燈照射1小時。
◆操作人員用肥皂洗手後進入緩衝間換拖鞋，用75%酒精棉球擦手，穿戴工作衣帽、口罩。將所需物品剝去牛皮紙及外包裝，從傳遞窗移入操作間，再用0.1%苯扎溴銨溶液泡手後進入操作間，在酒精(或煤氣燈)火焰區(火焰高度3-5cm)操作。
◆操作者不得用嘴直接吸吹吸管，防止致病菌感染操作人員及口中的雜菌污染供試品。
◆供試品表面消毒，如為安瓿先用砂輪劃痕後用2%碘酒棉球擦拭，再用75%酒精棉球擦拭、待干，也可以用消毒液浸泡消毒。
◆注射器如需回抽時，應對著火焰吸入無菌空氣。
◆在無菌操作中切勿大幅度或快速動作、拖行，以免攪動空氣中塵埃微粒。
◆所用的器材如培養基、稀釋劑配製後經121℃濕熱滅菌30分鐘，吸管培養皿等均應洗滌，乾燥，包紮後經160℃乾熱滅菌2小時才能使用。
◆無菌實驗室一般設置在微生物實驗室內，室內室外裝備的換氣設備須有空氣過濾裝置。在獲得了無菌環境和無菌材料後，只有保持無菌狀態，才能對某種特定的已知微生物進行研究。所以控菌能力和控菌穩定性是無菌室的核心驗收指標。業內通行的驗收標準為100級潔淨區平板雜菌數平均不得超過1個菌落，10000級潔淨室平均不得超過3個菌落，在通行標準之外，還應該定期保養與維護。只有建置時合理的選材指標，合適淨化等級和長期管理與維護，才能使無菌實驗室發揮其應有的作用。
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