淨氣型藥品櫃的頂部帶風機和過濾器，可將櫃內的有毒有害氣體吸收稀釋後排到室外，確保有害氣體不反向流進室內，接著再從櫃外補充新鮮空氣。值得注意的是，為保證這一功用的實現，一台通風櫃與一台藥品陰涼櫃用單一管道連接是好方法，不能用單一管道連接的，也只限制於同層同一房間的則可以並連，通風機儘可能安裝在管道的結尾處。
淨氣型藥品櫃無需安裝管道工程，安裝便捷，廢氣不外排，新型環保。頂部根據化學品類別可選配過濾模塊系統，滿足多種不同種類的化學品存儲。
先進模塊化過濾技術，完全吸附過濾實驗產生的有害氣體、顆粒粉塵等物質。無需消耗空調能耗，高效節省能源。移動方便，就近存儲，方便存取，提高工作效率。在線監測室內環境狀況和過濾器使用狀況，可根據實驗室環境級別，用戶自行設置安全提醒濃度。
對於外排型藥品櫃能夠將有毒有害氣體和顆粒排到室外，但需要接管道，工程量較大，相應的排風和補風系統需要進一步調節，以保證排風效果。且外排型藥品櫃耗電量大，會將空調冷暖風排出室外，造成能源損耗。麻煩的是，排出的有毒有害氣體是直接排放到室外，無疑破壞了實驗室周邊環境，後果很嚴重。
關於二者的選擇，消費者購買藥品櫃要根據實際需求來定，如果只是存放一些普通的無毒、無揮發性藥品，本著節約成本的原則，普通藥品櫃就是一個不錯的選擇，但如果需要存放一些特殊藥品，選擇淨氣型藥品櫃的性價比更高。